畜產科 分機：1530~1541
業務職掌：
| 1.畜牧場相關申請、審核及認定(家畜及禽畜牧場登記、畜牧設施容許及從來使用、畜牧動力用電等)。 |
| 2.畜牧產業輔導、推廣及污染防治輔導改善。 |
| 3.畜牧天然災害查報、斃死畜禽處理與輔導、畜牧飼料抽檢驗及管理、畜產品食品安全查核。 |
| 4.獸醫師開業及執業申請。 |
| 5.全縣養雞場雞糞處理查核。 |
| 6.屠宰場登記管理及本縣肉品市場管理。 |
| 7.家畜家禽違法屠宰查緝。 |
| 8.野生動物違法案件查緝取締及野生動物(海洋及陸域)救傷及危害處理。 |
| 9.保育類野生動物及其產製品登註記。 |
| 10.野生動物保護區及水鳥保護區經營管理。 |
| 11.海洋保育(小燕鷗)及海洋野生動物保育救傷(鯨豚、海龜)。 |
| 12.捕蜂捉蛇為民服務業務。 |
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