無尾港水鳥保護區成立已屆十三個年頭，在一切基礎資料記錄、監測等資料匱乏下，讓許多關心保護區的民眾或團體無所適從，但這十幾年來，經過許多人的努力及公部門的支持，這些重要的資訊也慢慢的建立，做為保護區日後經營管理的參考及指標。
無尾港文教促進會，累積十年的經驗及在地的精神，從2000年開始記錄及普查保護區之鳥況，也因便利的地緣關係，採頻率較高的調查方式，取得更確實的鳥況記錄，以利縣府在保護區內棲地上的管理及操作。
從五十年代湍急水流的感潮型形態，到慢慢堰塞的草澤型濕地，無尾港事實上是一個變化速度相當大的保護區，其間生物多樣性的變化，如何我們不得而知，然保護區內部的惡化，却是有目共睹的，未來這也是最迫切的課題。